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湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-06-18

我們測(cè)量了FucosEXO從一組dai表不同鍵的不同寡糖底物中釋放的巖藻糖。FucosEXO可有效釋放α1-2、α1-3和α1-4連接的巖藻糖,對(duì)α1-6連接的巖藻糖殘基沒(méi)有活Genovis的FucosEXO的底物特異性:巖藻糖以不同的鍵存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 連接的巖藻糖常見(jiàn)于 O-聚糖中,并作為 N-聚糖的天線巖藻糖基化,而 α1-6 連接的巖藻糖被發(fā)現(xiàn)是 N-聚糖he心的修飾。β1-3,4半乳糖的水解:Genovis的GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。上海倍篤生物涵蓋藥物研發(fā)的全流程,抗體結(jié)構(gòu)域分析蛋白酶、蛋白聚糖分析水解酶等。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

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C1抑制劑的去糖基化:在O-糖基化生物制藥的生產(chǎn)過(guò)程中,由于he心GalNAc殘基的加工不完全,可能會(huì)出現(xiàn)Tn抗原。這表現(xiàn)為具有 203 Da HexNAc 單位差異的重復(fù)質(zhì)量位移。為了確認(rèn) Tn 抗原的存在,可以應(yīng)用以下工作流程,此處在重度(26 個(gè)位點(diǎn))O-糖基化 C1 抑制劑上演示。首先,使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖,使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能測(cè)試?:依那西普是另一種具有挑戰(zhàn)性的生物制藥模型分子,攜帶 13 個(gè) O-聚糖位點(diǎn),其中平均 9 至 10 個(gè)位點(diǎn)被占用。山東N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病機(jī)理研究與絲氨酸或蘇氨酸連接的 GalNAc(稱為 Tn 抗原)被 GalNAcEXO 快速有效地水解。

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為了研究 OglyZOR 對(duì)天然糖蛋白的活性,將該酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒(méi)有 SialEXO 孵育 1 小時(shí)。當(dāng)唾液酸被去除時(shí),OglyZOR酶有效地水解了所有三種底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 (Gal-β1,3-GalNAc)。這使得這些酶適合在LC-MS分析之前制備樣品,以鑒定其他PTM或確認(rèn)氨基酸序列O-糖基化生物制藥的全去糖基化:O-糖基化生物制藥(如依那西普)很難表征。為了能夠通過(guò)質(zhì)譜法測(cè)定完整質(zhì)量數(shù),我們進(jìn)行了酶促總?cè)ヌ腔-聚糖被Genovis的PNGase F裂解,而O-聚糖可以與OglyZOR和SialEXO一起去除。。

從依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖:Genovis的GalactEXO Immobilized 對(duì) β1-3 和 β1-4 連接的半乳糖均具有酶活性,這些半乳糖存在于裝飾有 N- 和 O-連接糖基化的生物制藥中,例如 Fc-融合蛋白依那西普。將依那西普與GalactEXO固定化孵育60分鐘,并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亞基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分別分析。與GalactEXO Immobilized孵育導(dǎo)致N-連接和O-連接聚糖上的半乳糖殘基水解,這在半乳糖基化物種中被視為信號(hào)丟失。對(duì)游離的N-聚糖分析證實(shí)了LC-MS數(shù)據(jù)。用SialEXO處理血清,上樣于GlycOCATCH,洗滌,洗脫O-糖基化蛋白。Swiss Prot 數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定蛋白質(zhì)列表。

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GalNAcEXO固定化離心柱含有與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的GalNAcEXO酶,用于水解糖蛋白上的GalNAc殘基,而不會(huì)用酶污染制劑。Microspin 色譜柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的離心柱;2. 提高酶與底物的比例,提高消化效率;3. 終樣品中不含酶。用于水解離心柱中糖蛋白上的Genovis的GalNAc殘基的固定化酶。GalNAcEXO 酶是一種n 外α-N-乙酰半乳糖氨酸酶,可快速有效地水解來(lái)自天然 O-糖蛋白的 z es GalNAc 殘基。 該酶來(lái)源于Akkermansia muciniphila,在大腸桿菌中表達(dá),帶有His標(biāo)簽,分子量為52 kDa。 該酶在 Tn 抗原和 α1-3 連接末端 GalNAcs 上均顯示活性。在這里,我們展示了如何使用GalNAcEXO來(lái)表征復(fù)雜的生物制藥。因此,其水解需要底物蛋白以與酶活性相容的方式變性。廣東用于自動(dòng)化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物藥物開(kāi)發(fā)

GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

用于水解離心柱中糖蛋白上的N-聚糖的固定化酶。 Genovis的PNGase F 固定化微離心柱含有與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的 PNGase F 酶,用于在樣品中酶峰減少的糖蛋白上水解 N-糖。 將糖蛋白樣品與PNGase F一起在離心柱中固定,然后通過(guò)離心步驟輕松收集去糖基化的蛋白質(zhì)。由于空間位阻,PNGase F對(duì)某些糖蛋白的活性可能緩慢或受到抑制 - 在這些情況下可能需要更長(zhǎng)的孵育時(shí)間或糖蛋白變性。 Microspin 色譜柱可用于水解 5 或 10 x 0.2 mg 糖蛋白。1. 易于使用的離心柱;2. 提高酶與底物的比例,提高消化效率;3.z終樣品中的酶峰減少。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

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