Real-time PCR鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法：反應(yīng)緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計引物。引物量過多。減少反應(yīng)體系中引物的用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50ng，而基因組DNA則應(yīng)<200ng。外源DNA污染。確保操作的潔凈。陰性對照出現(xiàn)條帶：試劑，頭，工作臺污染。使用全新的試劑和頭，對工作臺進(jìn)行清潔。條帶大小與理論不符：污染。使用全新的試劑和頭，對工作臺進(jìn)行清潔。模板或引物使用錯誤。更換引物和模板。基因亞型。對研究的基因進(jìn)行序列分析和BLAST研究。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)較廣用于表達(dá)譜，以確定基因的表達(dá)或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列。PCR反應(yīng)的很大特點是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性。蘇州細(xì)胞熒光定量PCR

Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的特點：靈敏度高：PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的，能將皮克(pg=10-12）量級的起始待測模板擴(kuò)增到微克（μg=-6）水平。能從100萬個細(xì)胞中檢出一個靶細(xì)胞；在病毒的檢測中，PCR的靈敏度可達(dá)3個RFU(空斑形成單位）；在細(xì)菌學(xué)中很小檢出率為3個細(xì)菌。簡便、快速：PCR反應(yīng)用耐高溫的TaqDNA聚合酶，一次性地將反應(yīng)液加好后，即在DNA擴(kuò)增液和水浴鍋上進(jìn)行變性-退火-延伸反應(yīng)，一般在2～4小時完成擴(kuò)增反應(yīng)。擴(kuò)增產(chǎn)物一般用電泳分析，不一定要用同位素，無放射性污染、易推廣。純度要求低：不需要分離病毒或細(xì)菌及培養(yǎng)細(xì)胞，DNA粗制品及RNA均可作為擴(kuò)增模板。可直接用臨床標(biāo)本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細(xì)胞、活組織等DNA擴(kuò)增檢測。武漢微量Real-time PCR供應(yīng)商聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中。揚(yáng)州血液Real-time PCRReal-time PCR可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制。

Real-time PCR原理：Real-time PCR主要指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光物質(zhì)，然后通過熒光化學(xué)物質(zhì)監(jiān)測每次PCR反應(yīng)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法，之后通過內(nèi)參法或外參法對待測樣品中的特定DNA序列（目的基因）進(jìn)行定量分析的方法。實驗過程中，這些熒光物質(zhì)可以在激發(fā)光的作用下釋放出一定波長的發(fā)射光，定量用PCR儀通過對這些發(fā)射光進(jìn)行實時監(jiān)測，較終可以描繪出整個PCR的反應(yīng)過程，這就是Real-time PCR的原理。Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng)：DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈，在DNA聚合酶的參與下，根據(jù)堿基互補(bǔ)配對原則復(fù)制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發(fā)現(xiàn)，DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈，當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此，通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性，加入設(shè)計引物，DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。但是，DNA聚合酶在高溫時會失活。

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗污染：PCR反應(yīng)的很大特點是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性，但令人腦袋不適的問題是易污染，極其微量的污染即可造成假陽性的產(chǎn)生。污染原因：標(biāo)本間交叉污染：標(biāo)本污染主要有收集標(biāo)本的容器被污染，或標(biāo)本放置時，由于密封不嚴(yán)溢于容器外，或容器外粘有標(biāo)本而造成相互間交叉污染；標(biāo)本核酸模板在提取過程中，由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染；有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散，導(dǎo)致彼此間的污染。PCR試劑的污染：主要是由于在PCR試劑配制過程中，由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的，逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置。Real-time PCR與普通PCR的實驗?zāi)康牟煌詫σ锏脑O(shè)計要求也不同。

Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑：1.焦磷酸二乙酯（DEPC）：是一種強(qiáng)烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性，從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍：目前被認(rèn)為是較有效的RNA酶抑制劑，它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu)使核酸從蛋白中解離出來，又對RNA酶有強(qiáng)烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復(fù)合物：由氧化釩離子和核苷形成的復(fù)合物，它和RNA酶結(jié)合形成過渡態(tài)類物質(zhì)，幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑（RNasin）：從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑，可以和多種RNA酶結(jié)合，使其失活。5.其它：SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。實時熒光定量PCR是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中，以熒光化學(xué)物質(zhì)測聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。溫州分子生物學(xué)熒光定量PCR哪家好

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)又稱多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。蘇州細(xì)胞熒光定量PCR

Real-time PCR雙熒光標(biāo)記探針設(shè)計原則：具體的其他要求可以具體聯(lián)系設(shè)計公司，拿到合成好的引物，需要先確認(rèn)引物的性能。可以用這對引物先擴(kuò)增梯度稀釋后的標(biāo)準(zhǔn)品（標(biāo)準(zhǔn)品介紹見后續(xù)內(nèi)容）。由不同梯度標(biāo)準(zhǔn)品的加量和其對應(yīng)的Ct值，描繪出一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。這里要注意根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線得到的參數(shù)是非常重要的。引物性能確認(rèn)：1.決定系數(shù)R2大于0.98，越接近于1，結(jié)果越可靠。2.擴(kuò)增效率一般要求在0.8-1.2，越接近于1，越好。3.檢測的靈敏度，必須確認(rèn)，通常要求35個循環(huán)以內(nèi)，一般可以得到比較好的定量結(jié)果，30個循環(huán)以內(nèi)，沒有非特異性擴(kuò)增產(chǎn)生。4.NTC是必須要確認(rèn)的，通常要求30個循環(huán)內(nèi)沒有引物二聚體產(chǎn)生。蘇州細(xì)胞熒光定量PCR

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